Il chiostro è a pianta quadrata ed è situato ad immediato contatto con la fiancata destra della costruzione, cioè esposto a mezzogiorno, come si riscontra in tutte le chiese costruite dai Mortariensi.

In esso, di originale vi è soltanto la massicciata interna rialzata, mentre il porticato che lo circonda è lavoro completamente arbitrario, mancando qualsiasi traccia della sua originale struttura.